生物技术中心下设分子转化事件筛选实验室、生物信息学研究室、分子检测实验室、细胞生物学实验室、综合室五个部门。在人才队伍、设备条件、研究水平三个方面已经达到了国内同类实验室的先进水平。中心主任崔洪志博士是农业部有突出贡献青年专家，承担了多项国家级科研任务。中心目前的主要研究方向是第二代抗虫、高产、优质、抗病、抗逆、抗除草剂转基因棉花研究以及分子标记相关研究等。
