“Y两优900”具有“铁秆、巨穗、优质、多抗”的特点，产量潜力很大，抗倒性强，特别适合于土壤肥沃的平原地区和湖区栽培。2013年9月28日，国家农业部对湖南隆回县羊古坳牛形村101.2亩“Y两优900”高产示范片进行现场测产验收，平均亩产988.1公斤，创造了杂交水稻较大面积单产世界纪录，被指定为国家第四期超级稻亩产千公斤高产攻关的首选品种。“Y两优900”的生育期因其弱感光性而具有较大的可塑性，在华中、华东稻区生育期与两优培九相当，可作一季中稻栽培，4月中、下旬播种。在华南稻区栽培生育期明显缩短，可作早造、晚造双季稻栽培；作早稻栽培，3月上中旬播种，全生育期125天左右；作晚稻栽培，7月上旬播种，全生育期120天左右。
一、育秧移栽
采用水育稀播壮秧方式育秧，秧田翻耕后每亩施用45%的复合肥30公斤做底肥，过4～5天再平整秧厢播种。一季中稻每亩大田用种0.75-1公斤，华南早、晚稻每亩大田用种量不少于1公斤；每亩秧田播种7.5-10公斤。秧苗2叶1心期施好“断奶肥”，每亩用尿素3公斤；移栽前3～4天，每亩施用尿素5公斤作“送嫁肥”。
根据Y两优900的特征特性，一季中稻插植规格采用宽行窄株5×10寸（华南早、晚稻5×8寸）为宜，每穴2粒谷苗，每亩基本苗4-6万，宽行设置为东西行向，用专用划行器划行或拉线移栽，移栽时浅插，分蘖节入土2～3cm。
二、合理施肥
施肥总量根据各地土壤肥力状况和栽培习惯，一季中稻以每亩15-18公斤纯氮为宜，华南早、晚稻以12-15公斤纯氮为宜。氮肥施用的前后比例为基蘖肥:穗肥=6:4，氮、磷、钾的比例为1:0.6:1.1。肥料分基肥、分蘖肥和穗肥三类施用。
基肥结合大田耕整每亩施农家肥250公斤，45%的复合肥40公斤；也可每亩施用菜枯肥50公斤，45%的复合肥40公斤。
分蘖肥分1-2次施用。第一次，移栽后5-7天返青时施用尿素7-9公斤，氯化钾（含K2O为60%）7.5公斤；第二次，移栽后13天看苗情每亩施尿素3-5公斤、氯化钾5公斤做平衡肥（不缺肥不追第二次分蘖肥）。
穗肥分幼穗分化肥、促花肥和粒肥三次施用，当主茎进入幼穗分化二期左右时每公顷施尿素6-8公斤，45%的复合肥10-15公斤，氯化钾7.5公斤做幼穗分化肥；当主茎进入幼穗分化四期时每公顷施尿素3-5公斤，氯化钾7.5公斤做促花肥。在抽穗90%后每亩叶面喷施“谷粒饱”1.5包做粒肥。
穗肥施用的前提是群体叶色必须落黄，否则，应减量并延后施用；叶色提前褪色（幼穗分化2期以前）的多施，苗数偏少的多施；底肥施有农家肥的可少施。
三、科学管水
整田后抽好大田围沟，便于排灌和晒田。移栽后灌浅水，返青活棵到有效分蘖临界期间歇灌溉，即灌水1～2cm，自然落干3～4天后再灌水1～2cm，如此周而复始。每亩苗数达到15万左右时，开始排水晒田，采取多次轻晒的方法，晒到群体叶色落黄。若达到规定施穗肥的叶龄而叶色未转淡落黄，则应继续晒田，不能复水施肥。灌浆成熟期采用间歇灌溉，干湿交替，前期以湿为主，后期以干为主，以确保根系活力，防止早衰，提高结实率和充实度。
四、综合防治病虫害
病虫害实行以防为主，防治结合的统防统治方法。重点是秧田期稻蓟马，大田期二化螟、三化螟、稻纵卷叶螟、稻飞虱、稻瘟病、纹枯病等。近年南方水稻黑条矮缩病的有所加重，造成大面积减产、甚至失收，应引起高度重视；此病由飞虱、叶蝉等迁飞性昆虫传播，主要加强秧田期及大田前期的施药防治，达到“治虱防矮、治虫防病”的效果。